انجمن دارای سه نوع عضویت پیوسته، وابسته و افتخاری است.

اعضای پیوسته: افرادی که حداقل دارای مدرک سطح سه حوزوی و یا کارشناسی ارشد بوده و در انتخابات هیئت مدیره شرکت خواهند کرد. (از مجموع اعضای پیوسته انجمن، یک چهارم باید دارای مدرک سطح ۴ حوزه یا در حد سطح ۴ باشند. افراد مذکور باید دارای گرایشی تخصصی همخوان با زمینه فعالیت انجمن باشند. در غیر این‏صورت دارای یک تألیف و یا سه مقاله معتبر علمی در زمینه مذکور باشند.)

اعضای وابسته: افرادی که دارای مدرک سطح دو حوزوی یا کارشناسی دارای گرایش تخصصی همخوان با زمینه فعالیت انجمن باشند. این اعضا در انتخابات هیئت مدیره شرکت نخواهند کرد، ولی از مزایای دوره‌ها و برنامه‌های آموزشی انجمن استفاده خواهند کرد.

انجمن می‌‏تواند شخصیت‌‏های ایرانی و خارجی حوزوی را که مقام علمی آنان در زمینه تشیع و امامت حائز اهمیت است، بر اساس آیین‌نامه مصوب شورای اعطاء به عضویت افتخاری انجمن درآورد.